Chương trình đào tạo tích hợp Cử nhân - Thạc sĩ của Trường Đại học Hàng hải Việt Nam được xây dựng nhằm đào tạo nguồn nhân lực chất lượng cao, đáp ứng yêu cầu phát triển của nền kinh tế trong bối cảnh chuyển đổi số và hội nhập quốc tế. Ba chương trình gồm Cơ khí thông minh và Robot, Tự động hóa và Điều khiển thông minh, và Quản lý dịch vụ Logistics hàng hải được thiết kế theo lộ trình tích hợp 5 năm (3,5 năm bậc Cử nhân và 1,5 năm bậc Thạc sĩ), giúp người học hoàn thành đồng thời hai bậc đào tạo trong thời gian ngắn hơn so với học riêng lẻ. Thông qua cơ chế công nhận và liên thông tín chỉ giữa hai bậc học, chương trình không chỉ tối ưu thời gian, tiết kiệm chi phí mà còn tạo điều kiện để sinh viên sớm tiếp cận kiến thức chuyên sâu, phương pháp nghiên cứu hiện đại và nâng cao năng lực học thuật.